自高臺黑河濕地國家級自然保護區管理局成立以來，認真開展濕地資源和生態監測，逐步掌握保護區動植物資源分布狀況，利用山水林田湖草等生態恢復項目，積極實施濕地保護區生態恢復工程，切實改善保護區生態環境。加強生物多樣性保護，在濕地保護區開展植被恢復、圍欄禁牧、濕地生態補水等保護項目，強化落實保護區巡查管護措施，在候鳥重點棲息、繁殖區域設置大幅鳥類保護宣傳牌，利用“世界濕地日”、“世界環境日”、鄉鎮群眾趕集等活動，散發濕地保護宣傳單、播放濕地保護法規錄音等方式開展宣傳，全社會保護濕地資源的理念逐步增強。

通過落實各類保護措施，濕地保護區生態環境顯著改善，各類植物生長茂盛，鳥類棲息繁殖環境逐步好轉，生物多樣性功能日趨良好，濕地保護區水清草茂、百鳥翔集，處處都是大自然美景。至5月底，監測記錄濕地鳥類18目、40科、105種、約3萬余只，呈逐年增加趨勢。監測記錄國家重點保護的裸果木、胡楊等濕地長生植物48種，保護區植物生長良好。開展濕地重點水域水量監測面積4826.6公頃，淹水面積沒有明顯減少和退化現象。濕地保護區水質監測標準達到《地表水環境質量標準》三類以上，沒有發現水質污染情況。

經過近幾年濕地保護區生態環境整改和生態修復，濕地生態環境的逐步好轉，到濕地保護區棲息、繁殖的珍稀候鳥種群數量逐年增加。黑鸛、白尾海雕、金雕、大天鵝等國家Ⅰ、Ⅱ級重點保護鳥類都在濕地保護區棲息繁殖、遷徙越冬，黑鸛、白鷺、蒼鷺、鸕鶿等部分候鳥已變成留鳥，這也是濕地保護區生物多樣性功能明顯改善和生態環境好轉的重要標志。